Církev a náboženská společnost vzniká dobrovolným sdružováním fyzických osob a svébytně rozhoduje o věcech spojených s vyznáváním víry, o organizaci náboženského společenství a o vytváření k tomu určených institucí. Veškerá problematika je upravena zákonem 3/2002 Sb. o církvích a náboženských společnostech. Dřívější podmínka 10 tis. zletilých osob hlásících se k církvi byla opuštěna jako příliš omezující a zaregistrovat lze nyní církev, u níž se doloží nejméně 300 podpisů osob hlásících se k církvi.
Církev a náboženská společnost se stává právnickou osobou registrací. Rejstřík registrovaných církví a náboženských společností a dalších právnických osob podle zákona o církvích vede Ministerstvo kultury.
Návrh na registraci církve a náboženské společnosti podávají ministerstvu nejméně tři fyzické osoby, které dosáhly věku 18 let, mají způsobilost k právním úkonům a jsou občany České republiky nebo cizinci s trvalým pobytem v České republice.
Návrh na registraci církve musí obsahovat
- základní charakteristiku církve a náboženské společnosti, jejího učení a poslání,
- zápis o založení církve a náboženské společnosti na území České republiky,
- v originále podpisy nejméně 300 zletilých občanů České republiky nebo cizinců s trvalým pobytem v České republice hlásících se k této církvi a náboženské společnosti, s uvedením jejich osobních údajů podle tohoto zákona a s uvedením totožného textu na každém podpisovém archu, který uvádí plný název církve a náboženské společnosti, sbírající podpisy pro účel její registrace, a z něhož je patrné, že podpisový arch je podepisován pouze osobou hlásící se k této církvi a náboženské společnosti,
- základní dokument.
Základní dokument církve a náboženské společnosti musí obsahovat:
- název církve a náboženské společnosti, který se musí lišit od názvu právnické osoby, která již působí na území České republiky nebo která již o registraci požádala,
- poslání církve a náboženské společnosti a základní články její víry,
- sídlo církve a náboženské společnosti na území České republiky,
- označení orgánu církve a náboženské společnosti, který jedná jejím jménem s orgány veřejné správy a třetími osobami na území České republiky jako statutární orgán, způsob jeho jednání a jeho ustavování a odvolávání, délku funkčního období jeho členů, popřípadě označení dalších orgánů církve a náboženské společnosti a orgánů řeholních institucí, které jsou oprávněny podávat návrhy podle tohoto zákona, rozsah tohoto oprávnění a způsob jednání jménem církve a náboženské společnosti,
- osobní údaje členů orgánu podle písmene d), jsou‑li členové statutárního orgánu v době podání návrhu ustaveni,
- organizační strukturu církve a náboženské společnosti, včetně výčtu všech typů právnických osob, které budou navrhovány k evidenci, způsob jejich zřizování a rušení, včetně případného uvedení právního nástupce při jejich zániku, označení jejich statutárních orgánů, způsob jejich ustavování a odvolávání, délku funkčního období členů statutárních orgánů,
- způsob ustavování a odvolávání duchovních a seznam v církvi a náboženské společnosti používaných označení duchovních,
- způsob schvalování změn základního dokumentu a těch dokumentů církve a náboženské společnosti a jejich změn, které jsou přikládány k základnímu dokumentu, nebo z nichž jsou uváděny údaje do základního dokumentu,
- začlenění církve a náboženské společnosti do struktur církve a náboženské společnosti mimo území České republiky,
- zásady hospodaření církve a náboženské společnosti, zejména způsob získávání finančních prostředků, včetně rozsahu oprávnění osob, orgánů a jiných institucí církve nebo náboženské společnosti k nakládání s majetkem,
- způsob naložení s likvidačním zůstatkem, který vyplyne z likvidace církve a náboženské společnosti,
- práva a povinnosti osob hlásících se k církvi a náboženské společnosti.
Registrovaná církev či náboženská společnost pak může získat oprávnění k výkonu určitých zvláštních práv (např. vyučovat náboženství na státních školách podle zvláštního právního předpisu, konat obřady, při nichž jsou uzavírány církevní sňatky podle zvláštního právního předpisu, zřizovat církevní školy podle zvláštního právního předpisu, zachovávat povinnost mlčenlivosti duchovními v souvislosti s výkonem zpovědního tajemství nebo s výkonem práva obdobného zpovědnímu tajemství, je‑li tato povinnost tradiční součástí učení církve a náboženské společnosti nejméně 50 let).
Registrovaná církev a náboženská společnost s oprávněním k výkonu zvláštních práv každoročně zveřejňuje výroční zprávu o výkonu práv.
Návrh na přiznání oprávnění k výkonu zvláštních práv může podat registrovaná církev a náboženská společnost, která
- je registrována podle tohoto zákona nepřetržitě ke dni podání návrhu nejméně 10 let,
- zveřejňovala každoročně 10 let před podáním tohoto návrhu výroční zprávy o činnosti za kalendářní rok,
- plní řádně závazky vůči státu a třetím osobám,
- je bezúhonná.
Zrušení a zánik církve: Ministerstvo zahájí řízení o zrušení registrace
- na základě žádosti samotné církve nebo svazu církví,
- dojde-li ke zrušení konkursu po splnění rozvrhového usnesení nebo ke zrušení konkursu z důvodu, že majetek církve a náboženské společnosti nebo svazu církví a náboženských společností je zcela nepostačující,
- vyvíjí‑li registrovaná církev a náboženská společnost nebo svaz církví a náboženských společností činnost v rozporu s právním řádem,
- pokud nebyl po dobu delší než 2 roky ustaven orgán statutární orgán a předchozímu orgánu skončilo funkční období před více než 2 roky a nedošlo k ustanovení nových.
Po zrušení registrace církve a náboženské společnosti musí být provedena likvidace a likvidace všech jejích evidovaných právnických osob. Výjimkou je situace, kdy přechod práv a závazků je písemně převzat jinou registrovanou církví.